Gevher Nesibe Hastanesi Ağustos 1975 yılında bugünkü Devlet Hastanesi Cerrahi bölümünde ve halk sağlığı laboratuvarında hasta kabulüne ve eğitime başlandı. O zaman serbest döviz olmadığından üniversitenin ithali yoluyla ilk 5 küvez, 10 oksijen çadırı, 1 transport küvez ve 10 buhar makinesi temin edildi. İlk karyola, yatak, çarşaf, tansiyon aleti, mikroskop buzdolabı gibi tıbbi emtia “Gevher Nesibe Hastanesini Geliştirme Derneği” tarafından alındı.

Çocuk Sağlığı ve Hastalıklar Anabilim Dalı biri sosyal pediatri olmak üzere 5 odalı poliklinikte ve 10 yataklı yenidoğan ile 25 yataklı çocuk servisinde hizmet vermeye başladı. Servislerde Dönem IV ve Dönem VI öğrencileri aynı yıl eğitime başladılar. Yenidoğan Servisine hayırsever Emir Tuğbaş tarafından merkezi ısıtma ve oksijen tertibatı bağışlandı.

Anabilim Dalımızın kurucu Öğretim Üyesi olan Dr. Mustafa Öztürk Pediatrik Hematoloji Laboratuvar ve departmanını kurdu 1977 yılında Anabilim Dalımız kadrosuna katılan Dr. Neşide Çetin Yenidoğan ünitesini kurarak yıllar içinde tüm bölgeye hizmet verir hale getirdi. Dr. M. Akif Özdemir Onkoloji departmanından sorumlu öğretim görelisi olarak 1978 yılında göreve başladı. 1979 yılında Prof. Dr. İbrahim Erkul Anabilim dalımı kadrosuna katılarak Pediatrik Endokrinoloji Bilim Dalında hizmet vermeye başladı. Yine aynı yıl Prof. Dr. Enver Hasanoğlu’nun Fakültemize gelişi ile birlikte Pediatrik Nefroloji departmanı ve hemodiyaliz ünitesi faaliyete geçti. Takiben Dr. Alev Hasanoğlu’nun gelişi ile birlikte Metabolizma Laboratuvarı ve departmanı faaliyete başladı. 1981 yılında şu anda poliklinik binası olarak kullanılan bölümde yataklı hastaların tedavisi sürdürülürken 1988 yılından itibaren Gevher Nesibe Hastanesi merkez binasının 11 ve 12. katları çocuk hastaların tedavileri için ayrıldı. Bu bölümde yenidoğan, adölesan, süt çocuğu, intaniye, hematoloji-onkoloji, yoğun bakım servisleri yer alırken padiatrik nefroloji servisi Organ Nakli ve Diyaliz Hastanesinin 3.katında hasta hizmeti sundu.

Anabilim Dalımız bünyesinde Haziran 1995 yılında YÖK’ten Pediatri Kardiyoloji, Endokrinoloji, Metabolizma, Hematoloji, Onkoloji, Neonatoloji, Nefroloji, İmminoloji Bilim Dallarının kurulması talep edildi. 1996 yılında dekanlık tarafından Dr. Hasan Basri Üstünbaş Pediatrik Kardiyoloji Bilim Dalına, Dr. Selim Kurtoğlu Pediatrik Endokrinoloji ve Metabolizma Bilim Dalına, Dr. Türkan Patıroğlu Hematoloji ve İmminoloji Bilim Dallarına, Dr. M. Akif Özdemir Onkoloji Bilim Dalına, Dr. Neşide Çetin Neonatoloji Bilim Dalına, Dr. Ruhan Düşünsel Nefroloji Bilim Dalına Başkan olarak atandılar. 1996 yılında Pediatrik Gastroenteroloji Bilim Dalı kurulması talep edildi ve daha sonra Dr. Duran Aslan başkan olarak atandı. Dr. Sefer Kumandaş’ın İstanbul Tıp Fakültesinde Pediatrik Nöroloji yan dal uzmanlığını alarak dönmesinden sonra 1997 yılında Pediatrik Nöroloji bilim Dalı kuruldu ve Dr. Sefer Kumandaş başkanlığa atandı. Dr. Fulya Tahan’ın Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Pediatrik Allerji Ünitesinde yan dal eğitimini tamamlayarak Anabilim Dalımıza dönmesinden sonra 2004 yılında Pediatrik Allerji Bilim Dalı kurularak başkanlığına Dr. Fulya Tahan atandı.

Anabilim Dalımız bünyesinde hizmet veren Çocuk acil Ünitesi 2001 yılında 12 yatak ve 2 küvezden oluşan bir servisle hizmet kalitesini daha da artırdı. 2001 yılında pediatri süt çocuğu servisi içerisinde 6 yataklı bir oda ile hizmet vermeye başlayan yoğun bakım ünitesi Temmuz 2003 yılında Nazire ve Mustafa Patıroğlu adına yaptırılan 9 yatak kapasiteli yeni bir servise taşında. 2005 yılında Öğretim Görevlisi olarak kadromuza katılan Dr. Başak Nur Akyıldız bir yıl süre ile İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi’ne Yoğun Bakım alanında eğitilmek üzere gönderildi. 2006 yılı Haziran ayından itibaren Dr. Mehmet Köse üç yıl süre ile Göğüs Hastalıkları alanında eğitilmek üzere Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesine gönderildi. Ayrıca bir hemşiremizin Hacettepe Üniversitesi Pediatrik Enfeksiyon bilim dalında eğitilmesinden sonra 2006 yılı başından itibaren pediatri servislerinde de hastane enfeksiyon kontrol komitesi surveyans çalışmaları başlatıldı.

2009 yılı ikinci yarısından itibaren ise Mustafa Eraslan – Fevzi Mercan Çocuk Hastanesi faaliyete geçerek, yukarıda bahsedilen birimler bu yerleşkeye taşındı. Şubat 2022 yılında tamamlanarak hizmete açılan KANKA hastanesine KİT ünitesi ve Pediatri Hematoloji-Onkoloji departmanlarının taşınmasıyla bu üniteler faaliyetine bu yerleşkede devam etti. 2022 yılı ikinci yarısında Çocuk Nefrolojisi kliniği, Mustafa Eraslan-Fevzi Mercan Çocuk Hastanesine taşındı. Mustafa Eraslan – Fevzi Mercan Çocuk Hastanesi ve KANKA Hastanesi faaliyetlerine halen devam etmektedir.